1，与某一种模式菌株序列或非模式菌株序列同源性≥99%且高于其他种0.8%，可鉴定到种。2，与某一种模式菌株序列同源性≥99%但未高于其他种0.8%，，可鉴定到属，但不能排除相近的种。3，与某一种非模式菌株序列同源性≥99.5%，但与模式菌株同源性仅有97%。可鉴定到种。4，与某一种模式菌株序列或非模式菌株序列同源性在97%-98.9%之间，并能与其他属有较好区分度，可鉴定到属。若不能与其他属相区别，需依靠系统进化树鉴定到属。5，与模式菌株序列或非模式菌株序列同源性在95%-96.9%之间，可能是新属或是同源性最高某属的新种。6，与模式菌株序列或非模式菌株序列同源性＜95%，可能是新种或新属。具体要看同源性分析的结果，和进化树。
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