北京第二外国语学院设有英语学院、日语学院、旅游管理学院、国际经贸学院、跨文化研究院等22个教学科研机构。现有24个本科专业，其中日语、阿拉伯语、英语为教育部特色专业建设点，英语、日语、俄语、德语、阿拉伯语、旅游管理6个专业为北京市特色专业建设点。具有外国语言文学一级学科硕士授予权，13个二级学科硕士授权点，1个翻译硕士专业学位点；有外国语言文学（一级学科）、旅游管理、企业管理、国际贸易学4个北京市重点建设学科，北京旅游发展研究基地等省部级研究基地，并下设一流的中瑞酒店管理学院。
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