区别:明朝是为了防止流亡海上的敌对势力勾结倭寇,危机明朝统治(2分);清朝是为了对付东南沿海人民的抗清斗争。根本原因:是生产力水平低下的结果,是由自给自足的自然经济的封闭性导致的危害:不仅防碍了海外市场的开拓,抑制资本的原始积累,阻碍了资本主义萌芽的滋长;而且使中国与世隔绝,未能及时学习西方先进的科学知识和生产技术以发展生产力,中国逐渐落后于世界潮流。